技術概述
dsRNA(double-stranded RNA),雙鏈RNA在細胞內(nèi)誘導同源序列的基因表達受抑的現(xiàn)象稱為RNA干擾。
dsRNA 可以通過注射、電穿孔和化學試劑介導的轉染等方式介入動物和細胞內(nèi)。dsRNA的制備是實施RNAi較為關鍵的一步。目前常用的dsRNA制備方法主要有2 種:體外轉錄法和體內(nèi)載體表達法。其中體外轉錄法合成dsRNA可以在預期的PCR產(chǎn)物兩端連上轉錄起始點(如T7、SP6等),先用RNA聚合酶轉錄合成單鏈RNA, 再互補成dsRNA。
相比而言,要制備大量的dsRNA,采用體內(nèi)載體表達法即構建質粒,在細菌體內(nèi)表達更為經(jīng)濟高效。帶有發(fā)夾環(huán)的dsRNA包括2個反向互補的靶序列片段,中間插入一個單鏈環(huán)。通常構建這樣的DNA模板,需要3步連接(3步克隆法)實現(xiàn),這種方法操作較為繁瑣。
長鏈dsRNA設計合成流程:
1. 通過數(shù)據(jù)庫同源比對方法選取合適的目的基因序列
2. 目的基因序列的克隆
3. 向目的基因上加入接頭,可使用的接頭有T7,T3,SP6。
4. 體外反轉錄及雙鏈RNA退火。
5. 測定濃度。
技術詳情
參考文獻
[1]梁艷, Saksamerprome V , Sritunyalucksan K , et al. 一種大規(guī)模制備雙鏈RNA的簡單方法及其在斑節(jié)對蝦中的應用[J]. 水產(chǎn)學報, 2010, 34(7):1011-1017.
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