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分子量是蛋白質(zhì)關鍵特征參數(shù)之一，也是有機化合物最基本的理化性質(zhì)參數(shù)。分子量正確與否往往代表著所測定的有機化合物及生物大分子的結構正確與否。分子量同時也是多肽、蛋白質(zhì)等鑒定中首要參數(shù)，隨著基因組學和蛋白質(zhì)組學研究的推進，樣品蛋白質(zhì)分子量測定的科學研究工作已經(jīng)受到越來越廣泛的關注。

質(zhì)譜法分析（Mass Spectrometry,?MS）蛋白的基本原理是通過電離源將蛋白質(zhì)分子轉化為離子， 然后利用質(zhì)譜分析儀的電場、磁場將具有特定質(zhì)量與電荷比值（M/Z）的蛋白質(zhì)離子分離開來，經(jīng)過離子檢測器收集分離的離子，確定離子的M/Z值，分析鑒定未知蛋白。通常結合相應的處理及其他技術，能夠比較準確、快速地鑒定蛋白質(zhì)。